بَدَخْشان، سرزمینی کوهستانی در فلات پامیر که بخشی از آن در خاک افغانستان، و بخشی دیگر استان خودگردانبدخشان تابع جمهوری تاجیکستان است. نام آن در طول تاریخ به صورت بذخشان و بلخشان نیز ضبط شده است.
تاریخ بدخشان در دوره هخامنشی و پس از آن، به ویژه در آگاهیهای مربوط به تاریخ باختر۱ قابل پیجویی است. برخی چون توماشک برآنند که «استان کوهستانی» که یونانیان از آن یاد کردهاند، ظاهراً بدخشان بوده است.
در دوره ساسانی، بدخشان از مراکز تمدن هپتالی، و به قولی شهر بدخشان تختگاه آنان بود. برخی از محققان چون انوکی بر آن بودند که بدخشان خاستگاه اصلی هپتالیان بوده است.