«صادق طباطبایی در روایت صدر» شامل چهار بخش است: «گفت‌وگوها»، «یادداشت‌ها»، «نامه‌ها و کامنت‌ها» و «پیوست‌ها». بخش نخست شامل پنج گفت‌وگو درباره امام موسی صدر، آیت‌الله العظمی سیدصدرالدین صدر، حجت‌الاسلام والمسلمین سید مهدی صدرعاملی، سندی تاریخی درباره مظلومیت امام موسی صدر و شهید چمران و گفت‌وگویی در نقد سخنان سیدحمید روحانی (زیارتی) است.
بخش دوم نیز شامل ۶ یادداشت از مرحوم صادق طباطبایی درباره امام موسی صدر و پرونده ربودن ایشان است. بخش سوم شامل نامه‌های مهم طباطبایی و یادداشت‌های او و در نهایت بخش پیوست‌ها نیز شامل زندگینامه صادق طباطبایی و دو مطلب دیگر است. مقدمه این کتاب نیز به قلم فاطمه صدرعاملی (همسر زنده یاد صادق طباطبایی) است.
فاطمه صدرعاملی در بخشی از مقدمه خود بر این کتاب نوشته است: «کتابی که در دست دارید، حکایت از دو انسان دارد که اوقات خود را صرف بهبود وضعیت انسان‌ها کرده‌اند. گرچه مکان فعالیت آنها بسیار متفاوت بوده است. اما مسئولیت انسانی حد و مرز نمی‌شناسد. یکی امام و الگو بوده است و دیگری همراه و پیرو. اما هر دو، از امام بودن و پیرو بودن، به آنچه که معمولا از این دو اصطلاح برمی‌آید، قائل نبوده‌اند؛ بلکه در نوع ارتباط آنها، هم‌فکری و تعامل و تبادل‌نظر نیز بوده است ...